Производными энтодермы являются: Эпителий желудка и кишки, клетки печени, секреторные клетки поджелудочной железы, слюнных, кишечных и желудочных желез. Передний отдел эмбриональной кишки образует эпителий легких и воздухоносных путей, а также секреторные клетки передней и средней доли гипофиза, щитовидной и паращитовидной желез. Из мезодермы формируются: Cкелет, скелетная мускулатура, соединительно-тканная основа кожи (дерма), органы выделительной и половой систем, сердечно-сосудистая система, лимфатическая система, плевра, брюшина и перикард.
Из мезенхимы, имеющей смешанное происхождение за счет клеток трех зародышевых листков, развиваются все виды соединительной ткани, гладкая мускулатура, кровь и лимфа. Мезенхима – это часть среднего зародышевого листка, представляющая рыхлый комплекс разрозненных амебоподобных клеток. Мезодерма и мезенхима отличаются друг от друга по своему происхождению. Мезенхима большей частью эктодермального происхождения, начало же мезодерме дает энтодерма. У позвоночных, однако, мезенхима, в меньшей своей части, эктодермального происхождения, основная же масса мезенхимы имеет общее с остальной мезодермой происхождение. Несмотря на отличное от мезодермы происхождение, мезенхима может рассматриваться как часть среднего зародышевого листка. Зачаток конкретного органа формируется первоначально из определенного зародышевого листка, но затем орган усложняется и в итоге в его образовании принимают участие два или три зародышевых листка.
Для удобства рассмотрения хода гаструляции и ее результатов у хордовых весь процесс условно разделен на 2 этапа: ранний и поздний. В течение ранней гаструляции первоначально единый пласт клеток бластулы, реорганизуясь любым из приведенных выше способов, образует два слоя: наружный слой клеток эпибласт (у низших хордовых это эктодерма) и внутренний гипобласт (у низших хордовых это энтодерма). Таким образом, в результате ранней гаструляции формируется двуслойный зародыш и бластопор, а у млекопитающих и птиц, кроме этого, еще и некоторые внезародышевые органы. В ходе поздней гаструляции образуется мезодерма и комплекс осевых органов, а также внезародышевые органы. После появления мезодермы и определенных преобразований слои эпи- и гипобласта называются, соответственно, экто- и энтодермой.